La conception d'aptamères pour des cibles spécifiques doit être réalisée de manière à garantir que vous sélectionnez les aptamères qui se lient à votre cible tout en éliminant facilement les séquences qui ne le font pas. Typiquement, cela est accompli en immobilisant la cible de sorte que les aptamères qui se lient restent attachés, tandis que ceux qui ne se lient pas sont éliminés par lavage. Le grand inconvénient de l'immobilisation des cibles est que partie de la cible est retirée de la sélection du fait qu'elle est attachée au support solide. Cela pose problème avec chaque cible, des petites molécules (supprimant entièrement les épitopes pour la liaison) aux grandes protéines (pouvant affecter le pliage). Nous avons pu résoudre ce problème en développant la plateforme FRELEX, qui permet de séparer les aptamères liés à la cible de ceux qui ne le sont pas d'une manière où ni la cible ni l'aptamère ne sont immobilisés sur une surface.
Qu'est-ce que FRELEX ?
La plateforme FRELEX utilise une bibliothèque d'oligonucléotides courts aléatoires sur une puce d'or. Ces oligonucléotides courts agissent comme une « pelouse » sur laquelle les aptamères peuvent « s'asseoir » par hybridation via l'appariement Watson-Crick. Nous sélectionnons d'abord les séquences d'aptamères qui s'assoient sur cette pelouse sans que la cible soit présente. Les séquences qui se sont liées à la surface sont retirées, puis incubées avec la cible et réintroduites sur la pelouse de la puce d'or. Si l'aptamère se lie à la cible, il ne pourra pas s'asseoir sur la pelouse d'oligonucléotides et nous sommes capables d'isoler ces séquences loin des aptamères qui sont encore assis sur la pelouse, et donc pas occupés à se lier à la cible.
Cette approche nous permet de sélectionner des épitopes sur l'ensemble de la cible sans avoir à nous soucier de sélectionner des aptamères qui se lient de manière non spécifique à la surface d'immobilisation utilisée. Nous continuons à utiliser FRELEX pour sélectionner des aptamères pour les petites molécules et les protéines afin de garantir que nous concevons les meilleurs aptamères pour l'application diagnostique ou thérapeutique.
Pour en savoir plus sur le développement et les applications idéales de FRELEX, prenez contact avec notre équipe.
Le Dr. Gregory Penner a suivi une formation académique qui mêlait une théorie très pratique en matière de sélection végétale à la biologie moléculaire. Il a utilisé cette combinaison de biologie et de mathématiques pour développer et diriger une équipe de recherche en biotechnologie céréalière au sein du gouvernement du Canada, puis en tant que leader mondial de la recherche chez Monsanto Inc. Il a été un leader d'opinion en développement d'aptamères à l'échelle mondiale au cours des vingt dernières années en tant que PDG et président de NeoVentures. Il a dirigé cette entreprise vers la stabilité financière sans investissement extérieur grâce à une approche intégrée de la découverte et de la commercialisation des aptamères. En 2015, il a co-fondé une deuxième entreprise, NeoNeuro à Paris en France, axée sur une approche innovante pour identifier les Aptamarkers pour les maladies complexes.
Connectez-vous avec le Dr. Penner sur LinkedIn ou pour les mises à jour de l'entreprise, suivez NeoVentures.
French 
English 
Spanish