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B-cells can produce antibodies that are less likely to self-bind than aptamers

Comment nous évitons l'autoreconnaissance avec les aptamères

Antibody Binding vs. Aptamer Binding

La réponse immune s'est développée de manière très les méthodes de dépistage efficaces pour éliminer les anticorps qui se lient même faiblement à des cibles auto comme l'albumine sérique et l'IgG. La sélection des aptamères est réalisée en dehors du corps, sur la paillasse, ce quifournit de nombreux avantages mais la tolérance immunitaire implicite dans la sélection n'en fait pas partie. 

Diagram describing self-recognition in aptamers

 

Contre-sélection

La contre-sélection contre les hors-cibles a été la seule façon de produire des aptamères qui ne se lieront pas à d'autres cibles dans les fluides corporels. Le SELEX est basé sur l'utilisation de 1E15 séquences dérivées de 1,2E24 séquences possibles. Cela signifie que chaque sélection est basée sur un nouvel ensemble de séquences. Il n'a pas été possible de tester le même ensemble de séquences de départ sur différentes cibles. 

La contre-sélection est très efficace contre les séquences qui se lient étroitement à la hors-cible. Elle n'est pas efficace pour éliminer les séquences qui se lient faiblement. Pour être clair, la contre-sélection n'est pas aussi efficace ni aussi complète que la tolérance immunitaire. 

Cela a-t-il vraiment de l'importance ? Malheureusement, oui. Les protéines abondantes comme l'albumine sérique sont présentes dans le sang à une concentration moyenne de 600 uM. Si nous essayons de détecter des cibles à des concentrations beaucoup plus faibles, même une contre-liaison faible saturera la liaison des aptamères à l'albumine sérique. 

Notre solution

NeoVentures a surmonté ce problème avec notre nouvelle méthode de sélection d'aptamères Neomer.La méthode implique l'application en moyenne de 1 000 copies de chacune des mêmes 4,29 milliards de séquences à chaque cible. Cela signifie que nous pouvons identifier toutes les séquences qui se lient même faiblement aux protéines abondantes et les éliminer en tant que candidats pour votre cible. En essence, nous avons créé une alternative in silico à l'évitement de l'auto-reconnaissance. Il s'agit d'une innovation révolutionnaire qui entraînera certainement de meilleures performances des aptamères dans les applications de diagnostic. Lisez-en plus sur Neomer dans notre blog.

Pour en savoir plus sur ce que cela signifie pour votre capacité à utiliser des aptamères pour surmonter les problèmes dans votre portefeuille de diagnostics, contactez notre équipe dès aujourd'hui. 

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