La forme d'un aptamère est très importante pour son affinité de liaison à la cible. Cela est dû au fait que la forme lui permet de "s'adapter" à une cible, mais oriente également les nucléotides impliqués dans la liaison de manière à optimiser les interactions de liaison. Pour que les aptamères soient développés pour des produits commerciaux, ils doivent constamment être dans la forme idéale pour une liaison efficace. Cela signifie qu'une optimisation est nécessaire.
L'optimisation est nécessaire car, même si les aptamères sont toujours représentés dans une confirmation de forme unique, leur forme fluctue constamment à température ambiante. Cela peut créer un problème parce que si l'aptamère est dans une forme de liaison défavorable lorsqu'il entre en contact avec une cible, il ne se liera pas. Pour améliorer la liaison, l'aptamère doit être le plus souvent possible dans la forme qui permet la liaison. Nous utilisons la modélisation informatique de structures secondaires prédites en flux comme base pour la truncation et l'optimisation des aptamères.
Avec notre approche de modélisation in silico, nous augmentons régulièrement l'affinité et la spécificité de liaison à la cible des séquences, passant de leurs formes pleine longueur sélectionnées à des séquences plus courtes. La capacité de NeoVentures à utiliser les paysages énergétiques des aptamères pour optimiser la performance est un ingrédient crucial dans le développement d'aptamères qui peuvent être commercialisés.

Le Dr. Gregory Penner a suivi une formation académique qui mêlait une théorie très pratique en matière de sélection végétale à la biologie moléculaire. Il a utilisé cette combinaison de biologie et de mathématiques pour développer et diriger une équipe de recherche en biotechnologie céréalière au sein du gouvernement du Canada, puis en tant que leader mondial de la recherche chez Monsanto Inc. Il a été un leader d'opinion en développement d'aptamères à l'échelle mondiale au cours des vingt dernières années en tant que PDG et président de NeoVentures. Il a dirigé cette entreprise vers la stabilité financière sans investissement extérieur grâce à une approche intégrée de la découverte et de la commercialisation des aptamères. En 2015, il a co-fondé une deuxième entreprise, NeoNeuro à Paris en France, axée sur une approche innovante pour identifier les Aptamarkers pour les maladies complexes.
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