Annonce de l'avenir des aptamères : les Neomers

L'utilisation de la méthode SELEX traditionnelle pour le développement d'aptamères a conduit à l'identification d'aptamères se liant à une grande diversité de cibles. Cependant, il y a eu un succès limité avec les aptamères dans les applications thérapeutiques et diagnostiques. 

Un avantage clé du développement d'aptamères par rapport au développement d'anticorps est qu'il est réalisé in vitro en dehors des systèmes vivants. C'est également un inconvénient car les anticorps sont testés après leur développement pour leur capacité à se lier, même faiblement, à des auto-cibles dans le sang. La sélection traditionnelle d'aptamères n'a pas cette étape. La capacité à effectuer un criblage en utilisant une contre-sélection est utile, mais finalement pas suffisante car elle n'élimine pas efficacement les aptamères qui se lient faiblement aux auto-cibles.

 

Pourquoi est-ce un problème ? 

L'albumine sérique est présente dans le sang à une concentration de 600 µM. Les biomarqueurs les plus abondants sont présents à des concentrations allant de fM à faible nM. Cela signifie que pour chaque molécule cible présente, il y a des millions, voire des milliards, de molécules d'albumine sérique également présentes. Même une liaison très faible à l'albumine sérique saturera l'aptamère, ne laissant plus rien pour se lier à la cible, même si les aptamères se lient à la cible avec une très grande affinité. 

La liaison entre les ligands et les récepteurs est souvent mal comprise. Ce ne sont jamais des événements de liaison fixes. Ce sont des associations qui se font et se défont en microsecondes. Ainsi, la liaison doit toujours être considérée comme un équilibre. En tant que tel, la concentration de ce à quoi un ligand se lie est tout aussi importante que la force de liaison. 

 

La solution

Chez NeoVentures, nous avons toujours été des leaders dans le développement d'aptamères en tant que produits commerciaux. Avec notre invention de la méthode Neomer de développement d'aptamères, nous avons non seulement surmonté le problème traditionnel de l'absence de spécificité des aptamères, mais nous l'avons fait de manière si profonde que nous avons changé les fondements même de la science des aptamères. 

C'est une affirmation audacieuse, mais nous avons maintenant les données pour la soutenir. La méthode Neomer implique l'utilisation d'une bibliothèque des mêmes 4,29 milliards de séquences pour chaque sélection. Nous avons remplacé le besoin de cycles itératifs de sélection dans le SELEX en commençant avec une moyenne de 1 000 copies de chaque séquence dans cette bibliothèque au lieu d'une. Nous pouvons caractériser le niveau de liaison d'une molécule cible sur les 4,29 milliards de séquences en une seule sélection, suivie d'une astuce intelligente que nous utilisons pour l'analyse NGS. Nous avons caractérisé l'empreinte de l'HSA et des IgG sur cette bibliothèque et nous sommes en mesure de nous assurer que toute séquence qui se lie à ces protéines, même faiblement, est éliminée en tant que candidate pour votre molécule cible. 

 

L'avenir des aptamères

Le potentiel de cette nouvelle approche devrait être évident pour quiconque est impliqué dans le diagnostic ou la thérapeutique. Cela signifie que maintenant nous pouvons :

• Identifier des aptamères qui se lient au même épitope à travers les protéines
• Identifier des aptamères qui distinguent entre différentes isoformes d'une protéine
• Couplé à notre plateforme propriétaire FRELEX, Neomer permet l'identification définitive de métabolites solubles. 

Nous voulons partager l'accès à la plateforme Neomer aussi largement que possible. Ainsi, bien que nous fournissions désormais la plateforme comme base de notre activité de services payants, nous proposons également la bibliothèque Neomer sous forme de licence.Nous vous fournirons notre bibliothèque, vous effectuez la sélection vous-même, y compris l'analyse NGS, et nous analyserons vos données par rapport à notre base de données d'empreintes protéiques et métaboliques sur la même bibliothèque et vous fournirons les résultats. Nous faisons cela tout en maintenant notre engagement envers votre propriété des aptamères, sans redevance. 

Pour en savoir plus, prenez contact avec notre équipe.