Aptamarkers| neoaptamers https://neoaptamers.com/fr/category/aptamarkers/ Neoventures Biotechnology Inc. Mon, 13 Apr 2026 17:14:09 +0000 fr-FR hourly 1 https://wordpress.org/?v=7.0 https://neoaptamers.com/wp-content/uploads/2024/07/cropped-NeoVentures-Biotechnology-Square-Logo-No-Text-1-32x32.png Aptamarkers| neoaptamers https://neoaptamers.com/fr/category/aptamarkers/ 32 32 The Aptamarker Platform https://neoaptamers.com/fr/the-aptamarker-platform/ Tue, 30 Jul 2024 14:53:57 +0000 https://neoaptamers.com/?p=5952 Background: By translating information on protein abundance to information on DNA abundance High-Plex proteomics brings deeper analysis than transcriptomics on a protein level. Pioneers like Olink and Somalogic have been leaders in building a future based on protein abundance. There are, however, weaknesses in the approaches that they are using. The bottom-up approach of building… Lire la suite »The Aptamarker Platform

The post The Aptamarker Platform appeared first on neoaptamers.

]]>

Background:

By translating information on protein abundance to information on DNA abundance High-Plex proteomics brings deeper analysis than transcriptomics on a protein level. Pioneers like Olink and Somalogic have been leaders in building a future based on protein abundance.

There are, however, weaknesses in the approaches that they are using. The bottom-up approach of building panels of probes for individual proteins is powerful, but presents the following constraints.

  • Inability to characterize changes to proteins such as post-translational modifications and cleavage events.
  • Validation concerns surrounding dissimilarity in performance of probes individually and in conjunction with other probes
  • Limitation to reference set on human proteins
  • Need for new and expensive equipment
  • Accessibility to probes for Dx applications.

The Aptamarker platform:

At NeoVentures Biotechnology Europe (Paris) we have developed a top-down approach to High-Plex proteomics that overcomes the constraints listed above. Our top-down approach is based on our innovative system to applying the same 16.8 million aptamer sequences to different samples. We do not need to build a panel of probes from the bottom-up. We are characterizing the performance of our deep library of probes against samples where protein abundance has been characterized.

This approach solves the problems listed above as follows.

  • We have redundancy in terms of probes/protein binding. This enables us to detect and characterize post-translational changes.
  • Our probes are characterized within a library rather than individually, so their performance along with other probes is implicit to how we build information on them. We also validate performance of individual probes against targeted proteins through qPCR analysis.
  • Our library is completely agnostic in terms of what species it is applied to. We can work with human or other animal samples.
  • Our entire approach can be performed with existing equipment in any molecular biology laboratory. Our patented FRELEX selection method simplifies the process of quantification of aptamers by relying on a single microcentrifugation step to separate bound from unbound aptamers.
  • With 16.8 million probes our business model in able to provide a path to Dx applications.

To learn more about the Aptamarker platform and how it can help you extend the knowledge from your existing Olink or Somascan data contact us at info@neoventures-eu.com

You can characterize post-translational changes to candidate biomarkers, or you can rebuild your database so you can proceed to Dx applications.

The post The Aptamarker Platform appeared first on neoaptamers.

]]> How NeoVentures’ Aptamarker Platform Is Setting New Standards in Protein Measurement https://neoaptamers.com/fr/how-neoventures-aptamarker-platform-is-setting-new-standards-in-protein-measurement/ Mon, 01 Apr 2024 18:54:42 +0000 https://neoaptamers.com/?p=5869 In year three of the French revolution, a law was enacted to realize the rallying cry, “un roi, une loi, un poids, et une mesure” (One king, one law, one weight, and one measure). This became the introduction of the metric system. The one king idea may have been dropped shortly after, but the idea… Lire la suite »How NeoVentures’ Aptamarker Platform Is Setting New Standards in Protein Measurement

The post How NeoVentures’ Aptamarker Platform Is Setting New Standards in Protein Measurement appeared first on neoaptamers.

]]>

In year three of the French revolution, a law was enacted to realize the rallying cry, “un roi, une loi, un poids, et une mesure” (One king, one law, one weight, and one measure). This became the introduction of the metric system. The one king idea may have been dropped shortly after, but the idea of one system of measurement has survived. In all of science, our imagination is constrained by what we can measure and to advance the understanding it is absolutely necessary that everyone is talking about the same thing. However, this should not be mis-interpreted as meaning that we are measuring or understanding everything that needs to be known. 

Beyond the Canonical: Why Protein Measurement is Missing the Pathology

This is true when it comes to the science of proteomics. To advance the science it has been necessary to define canonical forms for protein measurement. The definition of a canonical form is based on our capacity for protein measurement. As such, the key is the amino acid sequence. Traditional proteomics (LC-MS/MS) has succeeded due to the creation of software that solves possibilities by relying on reference databases of protein sequences. The ability to identify isoforms and post-translational modifications has improved through the addition of information to the database.

High-plex proteomics platforms improve upon traditional ones by translating information about proteins abundance to DNA abundance. This allows for direct measurement by qPCR or next generation sequencing (NGS). Although these platforms can read multiple proteins at a time, they have been built in a traditional way by characterizing the binding of one probe to the canonical form of a protein. However, there is a flaw because most patho-physiologies are not caused by the canonical forms of proteins. They are caused by deviation from these forms. For Example, a sign of diabetes is the hyper-glycosylation of proteins in blood and Alzheimer’s is defined by mis-cleavage and mis-folding events.

The Aptamarker Platform: Capturing the Full Proteoform Spectrum

To address this need we have developed the Aptamarker platform. We have reinvented aptamer selection by designing libraries with a reduced number of random nucleotides interspersed by fixed sequences. This enables us to apply the same set of millions of probes to different biofluid or tissue samples. Subsequently, we can characterize the binding abundance of all these probes in one NGS analysis. This data contains all the information regarding canonical forms of proteins as well as information regarding their non-canonical forms. We are moving the science of proteomics ahead by moving our capacity to measure proteins beyond defined canonical databases.

“One king” may be returning in the form of artificial intelligence, the question for the future is what this means for “one measurement”.

To learn more about the Aptamarker platform and to investigate how you could become involved in a pilot study please visit us at neoventures-eu.com.

Photo credit: L. F. Labrousse (engraver). J. P. Delion, Paris (publisher)

The post How NeoVentures’ Aptamarker Platform Is Setting New Standards in Protein Measurement appeared first on neoaptamers.

]]> Revolutionizing Disease Detection: The Aptamarker Platform https://neoaptamers.com/fr/revolutionizing-disease-detection-the-aptamarker-platform/ Fri, 05 Jan 2024 18:00:13 +0000 https://neoaptamers.com/?p=5674 Aptamarker Paradigm Shift: NeoVentures Biotechnology’s Aptamarker platform challenges the traditional approach to biomarker discovery by eliminating the need to first understand the cause of a disease. Revolutionizing Healthcare: Aptamarker enables the identification of disease biomarkers without the constraints of unraveling disease causation, leading to faster and more efficient diagnostics. Wide-ranging Implications: The streamlined biomarker discovery… Lire la suite »Revolutionizing Disease Detection: The Aptamarker Platform

The post Revolutionizing Disease Detection: The Aptamarker Platform appeared first on neoaptamers.

]]>
  • Changement de paradigme des Aptamarkers : La plateforme Aptamarker de NeoVentures Biotechnology remet en question l'approche traditionnelle de la découverte de biomarqueurs en éliminant le besoin de comprendre d'abord la cause d'une maladie.
  • Révolutionner les soins de santé : Aptamarker permet l'identification de biomarqueurs de maladies sans les contraintes de comprendre la cause de la maladie, ce qui permet des diagnostics plus rapides et plus efficaces.
  • Implications Diverses : Le processus simplifié de découverte de biomarqueurs n'optimise pas seulement l'utilisation des ressources, mais élargit également l'application de la plateforme à divers domaines médicaux, des maladies infectieuses au cancer, ouvrant ainsi une nouvelle ère de soins de santé ciblés et personnalisés.

    • Dans le paysage en constante évolution de la biotechnologie, l'approche traditionnelle pour identifier les biomarqueurs et développer des thérapies et des diagnostics associés était basée sur la compréhension de la cause d'une maladie. Ce processus implique de définir l'état de la maladie, d'identifier ses origines, puis de repérer les biomarqueurs liés à la condition. Cependant, NeoVentures Biotechnology réécrit cette histoire avec sa plateforme révolutionnaire Aptamarker, une technologie révolutionnaire qui permet d'identifier les biomarqueurs de la maladie sans avoir besoin de comprendre d'abord la cause de la maladie.

    Le Paradigme Traditionnel

    De manière conventionnelle, le chemin vers la découverte de biomarqueurs a été un parcours méticuleux qui commence par la caractérisation de la maladie et la compréhension des mécanismes sous-jacents complexes. Les chercheurs rechercheraient ensuite des signatures moléculaires ou des biomarqueurs associés à l'état de la maladie, offrant des informations cruciales sur le diagnostic, le pronostic et les interventions thérapeutiques potentielles. Cette approche a sans aucun doute contribué de manière significative aux progrès médicaux, mais elle nécessite souvent beaucoup de temps, de ressources et une compréhension approfondie des voies biologiques complexes qui sous-tendent la maladie.

    Entrez NeoVentures Biotechnologie

    NeoVentures Biotechnology s'est imposé comme un pionnier dans le domaine en introduisant une approche révolutionnaire de la découverte de biomarqueurs. La plateforme Aptamarker utilise la méthode de sélection brevetée Neomer, représentant la prochaine génération de sélection d'aptamères et remplaçant la méthode SELEX traditionnelle. Cette méthode révolutionnaire transforme la sélection d'aptamères, autrefois considérée comme un art peu reproductible, en un processus scientifique systématique et clos, garantissant la fiabilité et la cohérence dans l'identification des biomarqueurs.

    Comment fonctionnent les Aptamarkers

    Aptamarker exploite la puissance des aptamères, des molécules d'ADN monocaténaire qui se lient spécifiquement à des molécules cibles. La méthode de sélection Neomer permet aux chercheurs d'identifier des biomarqueurs en comparant des échantillons de personnes atteintes d'une maladie spécifique à ceux de sujets en bonne santé. En utilisant la sélection d'aptamères, Aptamarker peut identifier des biomarqueurs présents (ou absents) dans les états pathologiques, contournant ainsi la nécessité de déchiffrer les facteurs causatifs de la maladie.

    Impact sur les Thérapies et les Diagnostics

    Les implications de la plateforme Aptamarker de NeoVentures Biotechnology sont révolutionnaires. Cette approche innovante rationalise le processus de découverte des biomarqueurs, permettant l'identification rapide de marqueurs de maladies potentiels. La capacité à identifier des biomarqueurs sans comprendre entièrement la cause de la maladie ouvre de nouvelles perspectives pour le diagnostic précoce, la médecine personnalisée et le développement de thérapies ciblées.

    1. Diagnostic précoce : La capacité d'Aptamarker à identifier précocement les biomarqueurs peut ouvrir la voie au diagnostic précoce, permettant aux professionnels de la santé d'intervenir de manière proactive et potentiellement d'améliorer les résultats pour les patients.
    2. La médecine de précision : Le potentiel de la plateforme à identifier des biomarqueurs spécifiques associés à différents états pathologiques permet le développement d'interventions thérapeutiques personnalisées et ciblées. Ce passage d'une approche universelle à la médecine de précision promet des traitements plus efficaces et adaptés.
    3. L'accélération du développement de médicaments: Avec un processus d'identification des biomarqueurs plus rapide et fiable, les délais de développement des médicaments peuvent être considérablement réduits. Cette accélération pourrait conduire à des essais cliniques plus efficaces et, en fin de compte, à un accès plus rapide à des traitements innovants pour les patients.
    4. L'optimisation des ressources : La méthode rationalisée d'Aptamarker réduit au minimum les ressources nécessaires à la découverte des biomarqueurs. Cela pourrait potentiellement réduire les coûts de recherche, rendant ainsi plus réalisable l'exploration d'une gamme plus large de maladies et de conditions.
    5. Application plus large : La polyvalence de la plateforme Aptamarker permet son application dans divers domaines de la maladie. Des maladies infectieuses au cancer et au-delà, l'innovation de NeoVentures Biotechnology a le potentiel d'avoir un impact sur un large éventail de disciplines médicales.

    The post Revolutionizing Disease Detection: The Aptamarker Platform appeared first on neoaptamers.

    ]]>