{"id":3358,"date":"2023-01-15T14:00:26","date_gmt":"2023-01-15T19:00:26","guid":{"rendered":"https:\/\/neoaptamers.com\/?p=3358"},"modified":"2024-02-26T13:21:17","modified_gmt":"2024-02-26T18:21:17","slug":"what-is-neomers","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/neoaptamers.com\/fr\/what-is-neomers\/","title":{"rendered":"lioth\u00e8ques d'aptam\u00e8res - Qu'est-ce que Neomers?"},"content":{"rendered":"

Les aptam\u00e8res sont s\u00e9lectionn\u00e9s \u00e0 partir de vastes biblioth\u00e8ques de s\u00e9quences al\u00e9atoires, donc les aptam\u00e8res eux-m\u00eames ne sont pas con\u00e7us mais les biblioth\u00e8ques \u00e0 partir desquelles ils sont s\u00e9lectionn\u00e9s le sont. La m\u00e9thode standard de conception d'aptam\u00e8res a \u00e9t\u00e9 la s\u00e9lection SELEX. Cela implique une biblioth\u00e8que synth\u00e9tique avec une r\u00e9gion al\u00e9atoire flanqu\u00e9e de deux sites de reconnaissance d'amorces.\u00a0<\/span><\/p>\n

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La r\u00e9gion al\u00e9atoire<\/h2>\n

La r\u00e9gion al\u00e9atoire est g\u00e9n\u00e9ralement longue de 40 nucl\u00e9otides. Cependant, il existe des contraintes substantielles avec cette conception de biblioth\u00e8que.<\/span><\/p>\n

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La s\u00e9quence al\u00e9atoire doit avoir au moins 40 nucl\u00e9otides de longueur pour explorer ad\u00e9quatement l'espace des structures. Si la r\u00e9gion al\u00e9atoire est plus courte que cela, il y a trop de potentiel pour que la r\u00e9gion al\u00e9atoire se replie sur les r\u00e9gions de reconnaissance d'amorce. Avec une r\u00e9gion al\u00e9atoire plus longue, il peut y avoir un repliement sur les s\u00e9quences fixes tout en permettant une variation suffisante dans la structure secondaire avec des r\u00e9gions sans repliement.\u00a0<\/span><\/p>\n

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Le probl\u00e8me avec cela est qu'avec 40 nucl\u00e9otides al\u00e9atoires, il y a 1,2E24 s\u00e9quences possibles (4^40). Cela \u00e9quivaut \u00e0 des kilogrammes d'ADN et est trop important pour \u00eatre utilis\u00e9 dans une r\u00e9action de s\u00e9lection. Une approche g\u00e9n\u00e9rale consiste \u00e0 commencer avec 1E15 s\u00e9quences. Cela semble beaucoup, mais cela repr\u00e9sente un tr\u00e8s petit sous-\u00e9chantillonnage des s\u00e9quences possibles.<\/span><\/p>\n

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Les limitations de SELEX<\/h2>\n

Probl\u00e8me 1<\/span><\/h3>\n

1E15 semble repr\u00e9senter un grand nombre de s\u00e9quences, mais il s'agit en r\u00e9alit\u00e9 d'un \u00e9chantillon tellement petit des 1,24 possibilit\u00e9s de s\u00e9quences qu'il est improbable que deux aliquotes de 1E15 s\u00e9quences contiennent m\u00eame des s\u00e9quences identiques. Cela signifie que la SELEX n'est pas reproductible. Toute s\u00e9lection pour une cible donn\u00e9e aboutira \u00e0 la s\u00e9lection de s\u00e9quences d'aptam\u00e8res diff\u00e9rentes.\u00a0<\/span><\/p>\n

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Probl\u00e8me 2<\/span><\/h3>\n

Chacune des 1E15 s\u00e9quences sera pr\u00e9sente en une seule copie. Cela signifie qu'il est probable qu'au moins 99,999 % des s\u00e9quences soient perdues d\u00e8s le premier tour de s\u00e9lection, y compris potentiellement les meilleures s\u00e9quences.\u00a0<\/span><\/p>\n

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Probl\u00e8me 3<\/span><\/h3>\n

Commencer avec une copie de chaque s\u00e9quence signifie que des tours de s\u00e9lection it\u00e9ratifs sont n\u00e9cessaires pour augmenter le nombre de copies des meilleures s\u00e9quences. Ce processus de s\u00e9lection it\u00e9rative et d'amplification par PCR est sujet \u00e0 un biais li\u00e9 \u00e0 l'amplifiabilit\u00e9 des s\u00e9quences de la biblioth\u00e8que. Les s\u00e9quences avec une structure secondaire plus \u00e9lev\u00e9e peuvent ne pas \u00eatre amplifi\u00e9es aussi bien que les s\u00e9quences avec moins de structure secondaire.\u00a0<\/span><\/p>\n

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Probl\u00e8me 4<\/span><\/h3>\n

Le d\u00e9veloppement d'anticorps int\u00e8gre un syst\u00e8me appel\u00e9 tol\u00e9rance immunitaire pour \u00e9liminer les anticorps qui se lient aux mol\u00e9cules produites par l'h\u00f4te (\u00e9vitement de soi). Cela signifie que les anticorps ne se lieront ni \u00e0 d'autres anticorps ni \u00e0 des cibles communes abondantes telles que l'albumine s\u00e9rique. Avec la SELEX, il est possible d'effectuer une contre-s\u00e9lection et d'\u00e9liminer les aptam\u00e8res qui se lient aux contre-cibles. La difficult\u00e9 avec cette approche est que la contre-s\u00e9lection fonctionne tr\u00e8s efficacement pour les aptam\u00e8res qui se lient fortement \u00e0 la contre-cible et ne fonctionne pas efficacement pour les aptam\u00e8res qui se lient faiblement \u00e0 la contre-cible. C'est un probl\u00e8me avec les contre-cibles telles que l'albumine s\u00e9rique, pr\u00e9sente \u00e0 une concentration moyenne de 600 uM dans le sang. Si une prot\u00e9ine cible est pr\u00e9sente \u00e0 une concentration de 600 pM, la diff\u00e9rence d'abondance est d'un milliard. M\u00eame si l'affinit\u00e9 de liaison d'un aptam\u00e8re pour la prot\u00e9ine cible est 1000 fois moindre pour l'albumine s\u00e9rique, la pr\u00e9sence de l'albumine s\u00e9rique le saturera toujours et interf\u00e9rera significativement avec la liaison. Il est n\u00e9cessaire d'introduire un syst\u00e8me de tol\u00e9rance immunitaire dans la s\u00e9lection des aptam\u00e8res.\u00a0<\/span><\/p>\n

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La Solution \u2013 NEOMERS<\/h2>\n

Pour surmonter ces contraintes, NeoVentures a d\u00e9velopp\u00e9 et valid\u00e9 une nouvelle approche de s\u00e9lection d'aptam\u00e8res que nous appelons Neomers. Les Neomers ne sont pas simplement des aptam\u00e8res am\u00e9lior\u00e9s bas\u00e9s sur la troncation d'aptam\u00e8res SELEX, comme le font d'autres options propri\u00e9taires propos\u00e9es par d'autres entreprises. Les Neomers repr\u00e9sentent une avanc\u00e9e dans le d\u00e9veloppement d'aptam\u00e8res avec une r\u00e9duction de la r\u00e9activit\u00e9 crois\u00e9e avec les cibles courantes dans les fluides biologiques.\u00a0<\/span><\/p>\n

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La conception exclusive de la biblioth\u00e8que Neomer comprend 16 nucl\u00e9otides al\u00e9atoires entrem\u00eal\u00e9s avec des nucl\u00e9otides fixes.\u00a0<\/span><\/p>\n

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C'est une perc\u00e9e dans la science de la s\u00e9lection des aptam\u00e8res car nous pouvons d\u00e9terminer si une s\u00e9quence donn\u00e9e de notre biblioth\u00e8que se lie m\u00eame faiblement \u00e0 des cibles abondantes dans des matrices pertinentes telles que :<\/span><\/p>\n